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<title>GROMOS</title>
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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">GROMOS</span></h1>
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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p><b>GROMOS</b> bezeichnet zum einen ein <a href="Kraftfeld_(Computerphysik)" title="Kraftfeld (Computerphysik)">Kraftfeld</a>, wie es zur Berechnung <a href="Molek%C3%BCldynamik" class="mw-redirect" title="Moleküldynamik">molekulardynamischer</a> Simulationen benötigt wird.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup><sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Es wurde an der <a href="Universit%C3%A4t_Groningen" class="mw-redirect" title="Universität Groningen">Universität Groningen</a> und der <a href="ETH_Z%C3%BCrich" title="ETH Zürich">ETH Zürich</a> entwickelt. Zum anderen ist GROMOS der Name für ein Softwarepaket für molekulardynamische Simulationen, das mit diesen Kraftfeldparametern verbunden ist.<sup id="cite_ref-3" class="reference"><a href="#cite_note-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Die aktuelle Version trägt die Bezeichnung GROMOS11.
</p><p>Das GROMOS-Kraftfeld, oder besser die Kraftfelder, da es verschiedene Versionen gibt, die sich in ihren Parametern unterscheiden, ist für die Simulation von <a href="Aminos%C3%A4uren" title="Aminosäuren">Aminosäuren</a> und <a href="Alkane" title="Alkane">Alkanen</a> optimiert, ist aber auch für <a href="Protein" title="Protein">Proteine</a> oder <a href="Zucker" title="Zucker">Zucker</a> einsetzbar. Es handelt sich um ein <i>united atom</i> Kraftfeld, bei dem einige <a href="Funktionelle_Gruppe" title="Funktionelle Gruppe">funktionelle Gruppen</a>, das heißt solche mit unpolaren Wasserstoffatomen zu einer Einheit verschmolzen wurden und in der Simulation als ein <a href="Atom" title="Atom">Atom</a> angesehen werden.
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>
<ol class="references">
<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">C. Oostenbrink, A. Villa, A.E. Mark and W.F. van Gunsteren: "A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation: the GROMOS force-field parameter sets 53A5 and 53A6" <a href="Journal_of_Computational_Chemistry" title="Journal of Computational Chemistry">Journal of Computational Chemistry</a> 25, 2004, 1656–1676.</span>
</li>
<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text">Lukas D. Schuler, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren: <i>An improved GROMOS96 force field for aliphatic hydrocarbons in the condensed phase.</i> Journal of Computational Chemistry 22 (11), August 2001, 1205–1218.</span>
</li>
<li id="cite_note-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-3">↑</a></span> <span class="reference-text">W.F. van Gunsteren, S.R. Billeter, A.A. Eising, P.H. Hünenberger, P. Krüger, A.E. Mark, W.R.P. Scott, I.G. Tironi: <i>Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide</i>, vdf Hochschulverlag AG an der ETH Zürich and BIOMOS b.v.: Zürich, Groningen, 1996.</span>
</li>
</ol>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>
<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.gromos.net">About the GROMOS software for biomolecular Simulation</a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.gromos.net/page.pl?page=howtoget">GROMOS11 Download</a></li></ul></div><!--htdig_noindex--><div><div class="zim-footer">
Dieser Artikel wurde von <a class="external text" title="Zuletzt bearbeitet am 2025-04-10" href="https://de.wikipedia.org/wiki/?title=GROMOS&oldid=255016848">Wikipedia</a> herausgegeben. Der Text ist unter <a class="external text" href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.de">Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0</a> verfügbar, sofern nicht anders angegeben. Für die Mediendateien können zusätzliche Bedingungen gelten.
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